Chì được khám phá ra tại thung lũng nhánh sông Joplin trước Nội chiến Hoa Kỳ, nhưng vùng này không mở mang cho đến thời kỳ sau chiến tranh. Vào năm 1871, sau khi nhiều mở kẽm được mở trong thung lũng, dân cư John C. Cox đệ trình một sơ đồ thành phố vào phía đông của thung lũng.[4] Cox đặt tên làng này là Thành phố Joplin (Joplin City) theo suối nước và nhánh sông chạy gần. Cả hai được đặt tên theo mục sư Giám Lý Harris G. Joplin.

Dân cư Patrick Murphy của Carthage cũng đệ trình một sơ đồ thành phố vào phía kia của thung lũng với tên Murphysburg.[5] Hai thành phố cuối cùng hợp nhất thành Thành phố Union (Union City), nhưng sự hợp nhất được quyết định là bất hợp pháp và hai thành phố bị chia. Theo lời đề nghị của Murphy, hai thành phố hợp nhất lại dưới tên Thành phố Joplin (City of Joplin) ngày 23 tháng 3 năm 1873.[6]

Năm 1933, trong thời Đại Suy thoái, đôi kẻ cướp nổi tiếng Bonnie và Clyde ở Joplin vài tuần.

Sau Chiến tranh thế giới thứ hai, phần nhiều mỏ kẽm đóng cửa và dân số không còn lên như về trước. Đường chính chạy ngang qua Joplin trở thành một phần của Xa lộ 66.

Ngày 22 tháng 5 năm 2011, Joplin bị cơn lốc xoáy mạnh tới EF-5 càn quét qua thành phố, làm ít nhất 138 người bị thiệt mạng và hơn 900 người bị thương và phá Trung tâm Y tế Vùng Thánh Gioan (St. John's Regional Medical Center), nhiều nhà cửa, và vài nhà trường.